課程大綱

課程資訊

課程名稱	合成生物學 Synthetic Biology - Design, Engineering and Evolution
開課學期	111-2
授課對象	生命科學院基因體與系統生物學學位學程
授課教師	吳亘承
課號	LS5085
課程識別碼	B21 U2290
班次
學分	2.0
全/半年	半年
必/選修	選修
上課時間	星期四6,7(13:20~15:10)
上課地點	生科419
備註	與周信宏、陳昇宏、黃筱鈞共授總人數上限：18人

課程簡介影片
核心能力關聯	本課程尚未建立核心能力關連
課程大綱
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課程概述	課堂中將講授基因選殖、誘變、演化篩選、電腦模擬與基因迴路的設計原理，介紹並討論經典與近期的合成生物學研究報告，學生將依研究興趣及專長分組報告與討論，同時於期末進行主題報告。
課程目標	學生暸解合成生物學的原理及應用，透過獨立思考及團隊合作構思嶄新的實驗技術、分析方法、以及在生技產業上的應用價值。
課程要求	1.學生須事前閱讀教材並於課堂上積極參與討論。 2.學生已修習普通生物學以及下列任一課程：生物化學、分子生物學、遺傳學、細胞生物學、微生物學、計算機程式設計、生物資訊學。如未修習相關課程，經與老師討論評估後可加修。 3. 歡迎非生科相關領域且對合成生物學有興趣的同學修習此課程
預期每週課後學習時數
Office Hours
指定閱讀
參考書目	Synthetic Biology: Tools and Applications, 2013 (ISBN: 978-0-12-394430-6) An Introduction to Systems Biology: Design Principles of Biological Circuits, 2006 (ISBN 978-1-58488-642-6) Synthetic Biology: Omics and Applications, 2018 (ISBN : 981-10-8692-3)
評量方式 (僅供參考)

課程進度

週次	日期	單元主題
第1週	2/23	[Lecture_Wu] Introduction to synthetic biology
第2週	3/2	[Lecture_Chou] Methodology of gene cloning, mutagenesis, and selection
第3週	3/9	[SLP_Chou] Promoter sequence & function: Modeling
第4週	3/16	[SLP_Chou] Promoter sequence & function: Deep mutational scanning
第5週	3/23	[Lecture_Chen] Introduction of quantitative biology and mathematical modeling
第6週	3/30	[Lecture_Huang] Signaling motifs and design principles in biology
第7週	4/6	[Lecture_Chen] Introduction of feedback control, bistability and trigger waves
第8週	4/13	[SLP_Chen] Ultrasensitivity: All-or-None Cell Fate Switch
第9週	4/20	[SLP_Chen] Ultrasensitivity: Turing on Biological Switches for Trigger waves
第10週	4/27	[Lecture_Huang] Genetic circuits in synthetic biology and their applications
第11週	5/4	[SLP_Huang] Mutual inhibition: memory
第12週	5/11	[SLP_Huang] Mutual inhibition: polarization
第13週	5/18	[Lecture_Wu] Quorum Sensing
第14週	5/25	[SLP_Wu] Quorum sensing: Anti-infective strategies
第15週	6/1	[SLP_Wu] Quorum sensing: Anti-infective strategies
第16週	6/8	Project presentation (encouraged but optional)